home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Celestin Apprentice 5 / Apprentice-Release5.iso / Source Code / Libraries / DCLAP 6d / dclap6d / SeqPups / tables / dro.cod < prev    next >
Text File  |  1996-07-05  |  3KB  |  95 lines
  1.  
  2. Drosophila melanogaster
  3.  
  4. 412 genes found in GenBank 63.
  5.  
  6.  Produced by J. Michael Cherry (cherry@frodo.mgh.harvard.edu) with the
  7.  GCG program CodonFrequency.
  8.  
  9.  Duplicates, pseudogenes, mutant and synthetic genes were not included.
  10.  Coding regions were specified using the Feature Table of each entry, then
  11.  checked for accuracy. If more than one stop codon was found the sequence
  12.  was not included.
  13.  
  14. AmAcid  Codon     Number    /1000     Fraction   ..
  15.  
  16. Gly     GGG      797.00      6.19      0.09
  17. Gly     GGA     2738.00     21.25      0.30
  18. Gly     GGT     2040.00     15.83      0.22
  19. Gly     GGC     3683.00     28.59      0.40
  20.  
  21. Glu     GAG     5011.00     38.89      0.68
  22. Glu     GAA     2394.00     18.58      0.32
  23. Asp     GAT     3291.00     25.54      0.53
  24. Asp     GAC     2867.00     22.25      0.47
  25.  
  26. Val     GTG     3214.00     24.95      0.44
  27. Val     GTA      758.00      5.88      0.10
  28. Val     GTT     1408.00     10.93      0.19
  29. Val     GTC     1882.00     14.61      0.26
  30.  
  31. Ala     GCG     1988.00     15.43      0.19
  32. Ala     GCA     1912.00     14.84      0.18
  33. Ala     GCT     2071.00     16.07      0.20
  34. Ala     GCC     4473.00     34.72      0.43
  35.  
  36. Arg     AGG     1135.00      8.81      0.14
  37. Arg     AGA      989.00      7.68      0.12
  38. Ser     AGT     1368.00     10.62      0.13
  39. Ser     AGC     2477.00     19.23      0.24
  40.  
  41. Lys     AAG     4672.00     36.26      0.70
  42. Lys     AAA     1979.00     15.36      0.30
  43. Asn     AAT     2523.00     19.58      0.45
  44. Asn     AAC     3136.00     24.34      0.55
  45.  
  46. Met     atg     2959.00     22.97      1.00
  47. Ile     ATA      975.00      7.57      0.16
  48. Ile     ATT     1985.00     15.41      0.33
  49. Ile     ATC     3013.00     23.39      0.50
  50.  
  51. Thr     ACG     1862.00     14.45      0.26
  52. Thr     ACA     1545.00     11.99      0.21
  53. Thr     ACT     1245.00      9.66      0.17
  54. Thr     ACC     2629.00     20.40      0.36
  55.  
  56. Trp     TGG     1526.00     11.84      1.00
  57. End     TGA      434.00      3.37      0.53
  58. Cys     TGT      902.00      7.00      0.31
  59. Cys     TGC     2000.00     15.52      0.69
  60.  
  61. End     TAG      138.00      1.07      0.17
  62. End     TAA      250.00      1.94      0.30
  63. Tyr     TAT     1254.00      9.73      0.37
  64. Tyr     TAC     2148.00     16.67      0.63
  65.  
  66. Leu     TTG     1679.00     13.03      0.16
  67. Leu     TTA      725.00      5.63      0.07
  68. Phe     TTT     1497.00     11.62      0.35
  69. Phe     TTC     2724.00     21.14      0.65
  70.  
  71. Ser     TCG     2072.00     16.08      0.20
  72. Ser     TCA     1093.00      8.48      0.10
  73. Ser     TCT     1055.00      8.19      0.10
  74. Ser     TCC     2441.00     18.95      0.23
  75.  
  76. Arg     CGG     1244.00      9.66      0.15
  77. Arg     CGA     1208.00      9.38      0.15
  78. Arg     CGT     1326.00     10.29      0.16
  79. Arg     CGC     2352.00     18.26      0.28
  80.  
  81. Gln     CAG     4557.00     35.37      0.68
  82. Gln     CAA     2119.00     16.45      0.32
  83. His     CAT     1560.00     12.11      0.41
  84. His     CAC     2218.00     17.22      0.59
  85.  
  86. Leu     CTG     4223.00     32.78      0.41
  87. Leu     CTA      926.00      7.19      0.09
  88. Leu     CTT     1085.00      8.42      0.11
  89. Leu     CTC     1622.00     12.59      0.16
  90.  
  91. Pro     CCG     2106.00     16.35      0.28
  92. Pro     CCA     1967.00     15.27      0.26
  93. Pro     CCT     1133.00      8.79      0.15
  94. Pro     CCC     2238.00     17.37      0.30
  95.